5’…..GAATTCATTCGGAGTTTTTGTATCTTGTTTCATAGTTTGTCCCAGGATTAGAATGATTAGGCATCGAACCTTCAAGAA
TTTGATTGAATAAAACATCTTCATTCTTAAGATATGAAGATAATCTTCAAAAGGCCCCTGGGAATCTGAAAGAAGAGAAGCA
GGCCCATTTATATGGGAAAGAACAATAGTATTTCTTATATAGGCCCATTTAAGTTGAAAACAATCTTCAAAAGTCCCACATCG
CTTAGATAAGAAAACGAAGCTGAGTTTATATACAGCTAGAGTCGAAGTAGTGATTtctagaGTTTTAGAGCTAGAAATAGCAAG
TTAAAATAAGGCTAGTCCGTTATCAACTTGAAAAAGTGGCACCGAGTCGGTGCTTTTTTAGAGCTGGTTTAGTGAACCGTC
AGATCCGCTAGA…..3’
EcoR I 位点:GAATTC
黄色底纹标示的序列:AtU6 Promoter
Xba I位点:tctaga
下划线标示的序列:sgRNA
※注:该启动子以碱基“G”为转录起始信号,要注意的是这个载体中不含转录起始碱基“G”,故靶位点引物设计时需要注意,说明书中已介绍。
以拟南芥AtRAN1基因为例进行oligo实操设计
(1)您可以通过以下在线工具设计:
CRISPR Design:http://cbi.hzau.edu.cn/cgi-bin/CRISPR
(2)选取
atttttcagGCTCTACCTAACCAGCAAACCGTAGATTATCCCAGCTTCAAGCTTGTCATTGTTGGTGATGGAGGCACAGgtacggt
(3)输入序列信息(以拟南AtRAN1基因为例)(4)点submit,出现右侧结果;
(5)根据左边不同Guide序列score的高低选取合适的Guide序列,score的高低并不代表敲除效率的高低,所以为提高敲除的成功率,一般选择2-3个Guide序列,构建2-3个敲除载体。
Cat.No. |
产品名称 |
规格 |
备注 |
GP0123 |
pP1C.3 |
4μg |
单子叶植物敲除载体 |
GP0122 |
pP1C.4 |
4μg |
双子叶植物敲除载体 |
GP0120 |
pPIC.7 |
4μg |
单子叶植物双敲载体 |
GP0143 |
pP1C.3 with DNA Recombinase |
50 rxns |
单子叶植物敲除试剂盒 |
GP0144 |
pP1C.4 with DNA Recombinase |
50 rxns |
双子叶植物敲除试剂盒 |
GP0119 |
pP1C.7 with DNA Recombinase |
50 rxns |
单子叶植物双敲试剂盒 |