❀pP1C.7质粒图谱
❀pP1C.7部分序列(U3 Promoter、U6 Promoter及靶点部分)
5’_AAACAGCTATGACATGATGGTACCGGTTCACTAAACCAGCTCTAAAAAAGCACCGACTCGGTGCCACTTTTTCAAGTTG
ATAACGGACTAGCCTTATTTTAACTTGCTATTTCTAGCTCTAAAACTCTAGAggcTCTAGATTGCCACGGATCATCTGCACAA
CTCTTTTAAATCAGCTTTGATCTATGTGGATAGCCGAGGTGGTACTAATACTAGTCTTTGTTGTCGTCCAATTGCGTAATGG
GCCGGCCCATACTGCAATACATGTCCTGAAAGGCTTCATGGCCCACTACGAAATGCTTTTCTCCTACAGTTTATCTTACTTC
TTCACATCACGTGGTTTCCAACGTACCCAGTGTTCCCGGCTTCCAGCATTTGCTGGTAGCACCAGTAGTAGTCGCCTGTCT
TGTGCTATGGTCCCTGACTGCACATCTGATTCCTCCAAGATCCATGCATGCCTGATAACTTTAAGTTGCTTCAGAAGAACTTT
AAGTGATCTGTTCGTATGTTTAAAGATCCCTTCATGGTCATAGGCGCGCCTTGTGAAAGTTGAATTACGGCATAGCCGAAGGA
ATAACAGAATCGTTTCACACTTTCGTAACAAAGGTCTTCTTATCATGTTTCAGACGATGGAGGCAAGGCTGATCAAAGTGATCA
AGCACATAAACGCATTTTTTTACCATGTTTCACTCCATAAGCGTCTGAGATTATCACAAGTCACGTCTAGTAGTTTGATGGTACA
CTAGTGACAATCAGTTCGTGCAGACAGAGCTCATACTTGACTACTTGAGCGATTACAGGCGAAAGTGTGAAACGCATGTGATG
TGGGCTGGGAGGAGGAGAATATATACTAATGGGCCGTATCCTGATTTGGGCTGCGTCGGAAGGTGCAGCCCACGCGCGCCG
TACCGCGCGGGTGGCGCTGCTACCCACTTTAGTCCGTTGGATGGGGATCCGATGGTTTGCGCGGTGGCGTTGCGGGGGAT
GTTTAGTACCACATCGGAAACCGAAAGACGATGGAACCAGCTTATAAACCCGCGCGCTGTAGTCAGCTTGGAATTCGTTTTAG
AGCTAGAAATAGCAAGTTAAAATAAGGCTAGTCCGTTATCAACTTGAAAAAGTGGCACCGAGTCGGTGCTTTTTTAGAGCTGG
TTTAGTGAACCGTCAGATCCGCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTGGCACTGGCCGT_3’
KpnⅠ位点:GGTACC
灰色底纹标示的序列:分别为gRNA1、gRNA2
XbaⅠ切割位点:黑色方框 TCTAGAggcTCTAGA
OsU3转录起始位点A的互补碱基:T
蓝色底纹标示的序列:OsU3启动子反向互补序列
绿色底纹标示的序列:OsU6启动子序列
OsU6转录起始位点:G
EcoRⅠ-HF切割位点:黑色方框GAATTC
HindⅢ位点:AAGCTT(1)您可以通过以下在线工具设计:
CRISPR Design:http://cbi.hzau.edu.cn/cgi-bin/CRISPR
(2)选取
atttttcagGCTCTACCTAACCAGCAAACCGTAGATTATCCCAGCTTCAAGCTTGTCATTGTTGGTGATGGAGGCACAGgtacggt
(3)输入序列信息(以拟南AtRAN1基因为例)
(4)点submit,出现右侧结果;
(5)根据左边不同Guide序列score的高低选取合适的Guide序列,score的高低并不代表敲除效率的高低,所以为提高敲除的成功率,一般选择2-3个Guide序列,构建2-3个敲除载体。
Cat.No. |
产品名称 |
规格 |
备注 |
GP0123 |
pP1C.3 |
4μg |
单子叶植物敲除载体 |
GP0122 |
pP1C.4 |
4μg |
双子叶植物敲除载体 |
GP0120 |
pPIC.7 |
4μg |
单子叶植物双敲载体 |
GP0143 |
pP1C.3 with DNA Recombinase |
50 rxns |
单子叶植物敲除试剂盒 |
GP0144 |
pP1C.4 with DNA Recombinase |
50 rxns |
双子叶植物敲除试剂盒 |
GP0119 |
pP1C.7 with DNA Recombinase |
50 rxns |
单子叶植物双敲试剂盒 |
Q-2:在进行植物细胞株的敲除载体构建前,还需要做哪些准备工作?
A-2:需要目的基因的表达情况分析,为防止因染色体缺失等情况导致靶基因缺失,首先需要 PCR 扩增靶基因,并对 PCR 结果进行测序,确保靶基因的完整存在;其次,您还可以用 RT-PCR 分析靶基因的活跃度。